Ce fonctionnement "en 2 fois" est tout à fait normal 
C'est une fonctionnalité désactivable, concernant uniquement la vitre conducteur :
Une impulsion brève sur le bouton du lève-vitres entrebaille la vitre de 2-3 cms.
Une seconde impulsion est ensuite nécessaire pour descendre la vitre jusqu'en bas.
J'aime bien cette fonctionnalité mais sinon, on peut la désactiver de façon simple :
1 - Mettre le contact
2 - Dans les 5 secondes, appuyer 2 fois "à fond" sur l'interrupteur de la vitre gauche, puis le tirer "à fond" 2 fois
3 - Couper le contact
4 - Dans les 40 secs, remettre le contact et renouveller rapidement l'étape 2
Voilà, c'est tout 
Pour réactiver la fonction "ouverture en 2 étapes", renouveller les étapes 1 à 4
Tout ceci est évidemment décrit dans le manuel du conducteur chap 3 pages 15 